科学家从粪便提取DNA鉴定出三种新种濒危叶猴

居住在新加坡的家从印尼叶猴。照片来源：维基百科／Andie Ang（CC BY-SA 4.0）
（神秘的粪便地球uux.cn报道）据环境资讯中心（姜唯 编译 林大利 审校）：近期研究发现，近几十年的定出保育工作成功使部分濒危鸟类和哺乳动物物种免于灭绝。但是种新种濒，许多资料不足的危叶物种和亚种的个体数量仍不断减少，此外，科学如果一个物种从未被发现，家从则无从保育。粪便
专家利用粪便分析 成功确认出三种新种叶猴
「我们对许多物种一无所知。定出要保护物种，种新种濒必须了解它们的危叶栖息地、食性偏好、科学遗传多样性和族群健全状况等。家从」新加坡国立大学教授鲁道夫．迈尔（Rudolf Meier）说。粪便
虽然DNA条码逐渐成为鉴定物种的重要工具，但收集DNA最理想的方式，各家看法不同。
其中一个可能性是动物粪便。 「过去我们得花两到三年的时间进行田野调查，收集关于一物种的最基本资讯，」迈尔说，「现在透过粪便分析可以快速搜集到这些资料。不仅能够获得粪便主人的DNA，还能了解其饮食习惯、肠道菌相和寄生虫量。」
英国卫报报导，迈尔和新加坡、印尼和英国的同事利用粪便分析确认了三种新种的叶猴。
莱氏叶猴（Presbytis femoralis）和东苏门答腊叶猴（Presbytis percura）以前被认为是印尼叶猴（Presbytis femoralis）的亚种。但现在已经确认这两种东南亚灵长类动物本身就属于独立的物种，因此根据世界自然保育联盟红皮书的评估标准，它们的受胁风险属于「极度濒危级」。该研究团队确认的第三个种罗氏叶猴（Presbytis robinsoni）则为「近危级」。
这三种叶猴都是黑色，仅脸部、四肢和腹部的白色斑纹略有不同，长期以来被认为是一种分布广泛的物种。它们在森林里很少落地，生性害羞、难以监测和拍摄。
粪便分析能在不打扰动物的情况下 完成物种资料收集
迈尔的研究《粪便DNA与物种救援》道出收集稀有物种资料的困难，因为「侵入性采样几乎是不可能的任务」。
「其他DNA来源只有三种。首先是博物馆标本，但博物馆中的标本数量往往很少，许多标本是在19世纪或20世纪初采集的，因此反映了在栖地大幅流失之前的历史遗传多样性。第二种是从「意外死亡」（如路杀）的标本中获得的组织样本。第三个来源是非侵入性样本，如毛发和粪便。 」
粪便样本可以在例行野外调查时收集，但这并非易事。户外条件有时很恶劣，需要长时间监控。为了确保动物不会感到被威胁，研究人员必须等待个体排便后离开，才能接近粪便。
该论文的共同作者之一、野生动物保护区新加坡保育基金会研究科学家安迪．昂（Andie Ang）说：「土壤中的叶猴粪便很难辨识，因为颜色大多也是棕色。有时叶猴粪便落下后撞到树枝或树叶，散在整片森林地面上，我们只能寻找非常小的碎片。」
「有时候粪便的气味够明显，有时可以跟着苍蝇或蜣螂的踪迹。」
收集粪便样本的好处是无非侵入性且不需要捕捉动物。与采血或使用耳夹不同，它不会干扰或压迫动物。
过去由于缺乏资讯 数种濒危叶猴未受保护
该研究使用市售试剂盒从叶猴粪便样本中提取DNA，送至外部机构进行定序。定序结果包含少量叶猴本身的DNA、它吃下的食物的DNA、寄生虫DNA，绝大多数是细菌的DNA。
另一位共同作者、新加坡国立大学研究员斯理法桑（Amrita Srivathsan）说：「我们用生物资讯学技术分离叶猴DNA序列，并从中重建了完整的粒线体基因组。」
「发现三种叶猴的心情很复杂。它们的族群很小且零散，这很令人担忧。但是至少现在它们可以被关注和保育……粪便分析提供的资讯对于理解物种的生态非常重要，有助于制定量身订做的保育策略。」
在新加坡，只有60只印尼叶猴栖息在一处管制森林地，而在马来西亚南部半岛柔佛海峡，由于棕榈油田迅速增加，个体数也在减少（250至300只）。
在印尼廖内省发现的东苏门答腊叶猴，大部分栖息地已被伐木和私人人工林所破坏。剩小群的东苏门答腊叶猴散布在传统橡胶园中，因为这些橡胶园仍然有一些天然植被。共同作者、西苏门答腊安达拉斯大学的灵长类动物学家里扎尔迪（Rizaldi）说：「由于缺少关于该物种的资料，它在印尼不被视为受保育的灵长类。我们的论文是让它受到保护的关键第一步。」
参考资料：《卫报》（2020年11月5日），Scatological science: how poo analysis could help save endangered species
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